Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SGCAQ16586 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCAQ16586 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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