Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCBQ16585 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SGCBQ16585 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SGCBQ16585 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCBQ16585 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SGCBQ16585 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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SGCBQ16585 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SGCBQ16585 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SGCBQ16585 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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SGCBQ16585 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCBQ16585 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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