Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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RPE65Q16518 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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