Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCOA1Q15788 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms