Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRIP13Q15645 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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TRIP13Q15645 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIP13Q15645 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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