Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC23BQ15437 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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