Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PUM3Q15397 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PUM3Q15397 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms