Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDK5R1Q15078 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms