Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRAM2Q15035 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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