Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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