Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ERV3-1Q14264 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms