Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTTNQ14247 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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