Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
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