Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms