Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1SQ13698 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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