Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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