Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEUROD1Q13562 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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