Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LSAMPQ13449 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LSAMPQ13449 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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LSAMPQ13449 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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LSAMPQ13449 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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