Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDAP1Q13442 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDAP1Q13442 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms