Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
XRCC4Q13426 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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