Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HSPB3Q12988 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms