Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms