Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMAN2Q12907 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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