Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NFIAQ12857 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIAQ12857 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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