Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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STX4Q12846 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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STX4Q12846 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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STX4Q12846 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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