Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TROQ12816 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TROQ12816 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TROQ12816 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TROQ12816 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TROQ12816 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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