Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP4Q09028 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms