Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LOXL1Q08397 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms