Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRKCDQ05655 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms