Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RELAQ04206 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RELAQ04206 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms