Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms