Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVFC1P60507 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVFC1P60507 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms