Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM15P57071 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms