Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLTPP55058 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLTPP55058 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLTPP55058 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLTPP55058 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLTPP55058 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms