Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHB3P54753 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPHB3P54753 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms