Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB5CP51148 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RAB5CP51148 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RAB5CP51148 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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