Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRATP43155 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CRATP43155 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRATP43155 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRATP43155 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms