Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GRIK1P39086 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms