Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGAEP38570 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGAEP38570 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms