Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM23P36406 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms