Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJC1P36383 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJC1P36383 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms