Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTN2P35609 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms