Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCGF2P35227 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms