Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP1P29466 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP1P29466 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP1P29466 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP1P29466 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms