Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GCAP28676 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCAP28676 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCAP28676 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCAP28676 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms