Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMBRP28336 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NMBRP28336 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NMBRP28336 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NMBRP28336 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms