Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HLA-DMAP28067 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms