Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LMO1P25800 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LMO1P25800 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LMO1P25800 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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