Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTSSP25774 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CTSSP25774 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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