Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms